Хронични възпаления, персистиращи грануломи или кисти, които не се повлияват от ендодонтско лечение, не налагат непременно екстракция. Чрез апикална резекция (апекотомия) се отстранява засегнатия връх на корена и околната инфектирана тъкан, с цел запазване на зъба и възстановяване на здравата периапикална зона.
